Esta fue diseñada mediante un proyecto impulsado por el Instituto de Cultura Puertorriqueña. Tiene un fondo rectangular color amarillo intenso que significa el sol, símbolo de la vida física. En su centro tiene una cruz púrpura, símbolo del cristianismo y su orden eclesiástica representa la vida espiritual. La cruz púrpura se extiende a todos los puntos del rectángulo amarillo, como símbolo de la universidad del cristianismo y de la iglesia.
Este proyecto de la Bandera de Peñuelas fue creado en el año 1974.
