Dedido al fuerte contrabando que existía en esta zona portuaria "Puerto de Tallaboa" y en vista de la piratería y demás actos criminales de todo género, aquellas ochenta familias pacíficas y trabajadoras optaron por trasladar su original vivienda al lugar que actualmente ocupa el pueblo en búsqueda de mayor seguridad, protección y sosiego. Es aquí donde este grupo de habitantes encabezados por Diego de Alvarado, construye el núcleo fundacional del pueblo de Peñuelas.
El 25 de agosto de 1973, después de numerosas gestiones efectuadas por los ciudadanos del pueblo, se llevó a cabo la declaración del mismo y la creación de la parroquia: y en esa fecha, oficialmente se funda el pueblo de San José de Peñuelas. El nombre de Peñuelas tiene su origen de los grandes peñascos o se relaciona con seboruco, que en el idioma taíno significa peñascos o piedras pequeñas. El 1 de marzo de 1902 la Asamblea Legislativa de Puerto Rico aprobó una Ley para la Consolidación de Ciertos Términos Municipales por la cual suprimió el municipio de Peñuelas, y sus funcionarios y barrios fueron anexados al de Ponce. Tres años después, en 1905, la Asamblea Legislativa revocó dicha ley y constituyo nuevamente el municipio.
